Анапа находится на 44° северной широты и 37° восточной долготы, на стыке гигантских геологических структур: складчатого сооружения Большого Кавказа и края Русской платформы — громадного плато, занимающего пространство от Балтики и Черного моря до Урала. В рельефе это выражается большим разнообразием ландшафтов. Город расположен на каменистом плато с обрывистым берегом высотой 20-30 м и на его пологом склоне, переходящем в низменность. К юго-востоку от города возвышаются отроги Кавказских гор, они начинаются от моря с горы Лысой и переходят в Семисамский хребет. На севере от Анапы расположена холмистая гряда с горой Султанской и высотой Оцекутан. За грядой — обширная приазовская низменность.
К северу от города расположены песчаные пляжи, протянувшиеся на 40 км, к югу — галечные пляжи по берегам небольших бухт. Море в районе Анапы самое благополучное в Черноморском бассейне, мелководье с плотным песчаным дном и хорошей прогреваемостью в летние и осенние месяцы.
Климат Анапы — средиземноморского типа, предгорно-степной, умеренно влажный и теплый, с достаточно устойчивым барометрическим давлением. Среднегодовая температура воздуха составляет +14,3°C. По числу солнечных дней в году (суммарно 2460 часов) Анапа занимает одно из первых мест среди курортов Черноморского побережья.
Значительную роль в формировании климата играют циркуляция атмосферы и ветры. В движении воздушных масс участвуют с севера потоки арктического воздуха и умеренных широт, с юга — морского и тропического воздуха, с преобладанием в летнее время примерно в равной степени северо-восточных, юго-западных и западных ветров, в зимнее время — с преобладанием северо-восточных ветров.
Регион богат минеральными водами внутреннего и наружного применения, эксплуатируются воды Семигорского, Анапского, Бимлюкского, Пионерского месторождений.
В окрестностях Анапы имеются богатейшие запасы лечебных иловых сероводородных грязей Витязевского и Кизилташского лиманов, озера Чембурка. Эксплуатационные запасы пелоидов составляют свыше 5 млн. тонн. В регионе насчитывается свыше 30 псевдовулканических сопок с большими запасами лечебной сопочной грязи.
Информация предоставлена музеем "Горгиппия".